OpenAI 要研究人類(lèi)長(cháng)壽問(wèn)題了??推出新模型 GPT-4b micro。
可以設計出將普通細胞轉化為干細胞的蛋白質(zhì)。
據 MIT 科技評論消息,這是 OpenAI 首個(gè)專(zhuān)注于生物數據的大模型,也是 OpenAI 首次公開(kāi)聲稱(chēng)其模型可以帶來(lái)意想不到的科學(xué)發(fā)現。
研究合作方 Retro Biosciences,一家成立于 2022 年的創(chuàng )業(yè)公司,專(zhuān)注于“抵抗細胞衰老的新藥開(kāi)發(fā)”,包括細胞重編程、自噬和受血漿啟發(fā)的療法。
聯(lián)合創(chuàng )始人丁勝,為清華藥學(xué)院創(chuàng )始院長(cháng)(于 2022 年 6 月卸任院長(cháng),仍繼續在藥學(xué)院任教并從事研究工作)。
丁勝教授團隊首次以化學(xué)小分子組合體外定向誘導小鼠全能干細胞并穩定培養,成果在 2022 年登上 Nature。
另一位聯(lián)合創(chuàng )始人 Joe Betts-LaCroix,在加州理工期間首次闡明了蛋白質(zhì)中電子隧道速率的控制因素,成果登上 Science,Joe 還在 YC 擔任過(guò) 2.5 年的兼職合伙人(伏筆),指導和投資了眾多生物初創(chuàng )公司。
2022 年 4 月,Retro Biosciences 對外披露已獲得 1.8 億美元融資,但對投資人身份守口如瓶。
直到 ChatGPT 推出之后,2023 年 3 月世界才知道,這位神秘投資人正是 OpenAI CEO 奧特曼本曼。
Retro Bioscience 也開(kāi)始被稱(chēng)為“抗衰界的 OpenAI”。
要為人類(lèi)延壽 10 年
Retro 的目標是將人類(lèi)的正常壽命延長(cháng) 10 年。
Retro 與 OpenAI 正式合作開(kāi)始于一年前,他們研究的重點(diǎn)是山中因子(Yamanaka factors),由諾獎得主山中伸彌在 2006 年提出。
山中因子是一組蛋白質(zhì),可以將人類(lèi)皮膚細胞轉化為看起來(lái)更年輕的干細胞。不過(guò),這種細胞“重編程”效率并不高,需要數周時(shí)間,且經(jīng)實(shí)驗室培養皿處理的細胞中不到 1% 能完成再生。
為此,OpenAI 開(kāi)發(fā)了名為 GPT-4b micro 的新模型,用于提出改進(jìn)蛋白質(zhì)因子功能的方法。
OpenAI 用大量物種的蛋白質(zhì)序列實(shí)例以及蛋白質(zhì)相互作用相關(guān)信息訓練了 GPT-4b micro。
其工作方式與谷歌的 AlphaFold 大不相同,AlphaFold 用于預測蛋白質(zhì)結構,山中因子則是一類(lèi)異常松散且無(wú)固定結構的蛋白質(zhì)。
Retro 的科學(xué)家嘗試引導模型生成可能的山中蛋白質(zhì)重新設計方案,使用的是類(lèi)似于“few-shot”的提示,即用一系列帶有答案的示例作為上下文提示,隨后添加一個(gè)需要模型生成答案的新示例。
盡管基因工程師可以在實(shí)驗室中通過(guò)一定的方法引導分子進(jìn)化,但受限于實(shí)驗條件,他們通常只能測試有限的可能性,但對于典型長(cháng)度的蛋白質(zhì)來(lái)說(shuō),其改造方式幾乎是無(wú)限的。
OpenAI 的模型卻能經(jīng)常生成含顯著(zhù)改動(dòng)的設計建議,其中三分之一的蛋白質(zhì)氨基酸被改變。
Retro CEO Joe Betts-Lacroix 指出,該模型提出的建議很好:
我們立即將這個(gè)模型應用到了實(shí)驗室,并得到了實(shí)際的成果。
OpenAI 也介紹道,研究人員根據模型的建議對兩個(gè)山中因子進(jìn)行了改造,根據初步測量結果,其效果提升了 50 倍以上。
OpenAI 研究員 John Hallman、Aaron Jaech 和 Retro 的 Rico Meinl 是該模型的開(kāi)發(fā)負責人。
John Hallman 表示:
從整體來(lái)看,這些蛋白質(zhì)的性能似乎比科學(xué)家自己設計的要好得多。
不過(guò),在研究結果發(fā)表之前,外界科學(xué)家無(wú)法驗證這些結果的真實(shí)性。并且該模型目前也未對外開(kāi)放使用,目前只有一個(gè)定制化的展示案例。GPT-4b micro 是如何得出這些猜測的,也仍然不清楚。
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